除雙孢菇、雞腿菇等必須采用發(fā)酵料栽培外，平菇、姬菇等也有應(yīng)用發(fā)酵料栽培的。多年的生產(chǎn)實(shí)踐表明：發(fā)酵料栽培中的問題之一就是基料發(fā)酵不均勻、熟化度不一、含水率不一，甚至出現(xiàn)厭氧發(fā)酵現(xiàn)象。因此，基料翻堆時(shí)要內(nèi)外均勻、上下均勻，根據(jù)發(fā)酵溫度和天氣狀況，每次翻堆應(yīng)適當(dāng)補(bǔ)水；雙孢菇基料的二次發(fā)酵，一定要達(dá)到溫度要求，并保持規(guī)定的時(shí)間，否則，極有可能導(dǎo)致栽培失敗。
氣溫尚高，注意蟲害
大多數(shù)地區(qū)從3月至10月底，菇蚊菇蠅類害蟲基數(shù)一直較大，尤其是菇蠅，基料拌料或發(fā)酵期間，它們趨味而來，在基料附近產(chǎn)卵，使得生料栽培時(shí)帶卵接種，發(fā)酵料栽培時(shí)活蟲進(jìn)袋，發(fā)菌期間便會(huì)形成危害，導(dǎo)致“退菌”（開始階段菌絲濃密，而后菌絲越來越少）。因此，拌料前先清理周邊環(huán)境，噴灑敵敵畏與多菌靈800倍混合液1次；拌料或裝袋期間，若有菇蚊菇蠅類害蟲，則噴灑菊酯類藥物1000倍液驅(qū)殺，并盡快完成接種。發(fā)酵料則在最后一次翻堆前用辛硫磷800倍液噴灑，以防害蟲在基料附近產(chǎn)卵，或殺死已孵化的幼蟲，接種前再噴灑菊酯類藥物1000倍液驅(qū)殺。
濕度較大，注意防雜
秋季栽培食用菌，空氣相對(duì)濕度及地面水分均較大，如在大棚發(fā)菌，遇有高溫或通風(fēng)不好，發(fā)生污染的幾率相當(dāng)大。污染主要是常見的木霉、曲霉、毛霉等，熟料栽培時(shí)，鏈孢霉則是“頭號(hào)殺手”，一旦形成蔓延，將導(dǎo)致栽培失敗。因此，發(fā)菌棚啟用前要嚴(yán)格消毒殺菌，清理干凈后，噴灑百病傻、賽百09等藥物，然后揭開草苫曬棚，使藥物充分發(fā)揮作用，2天后覆蓋草苫，在地面撒一層石灰粉，之后即可將接種后的菌袋移入，進(jìn)入發(fā)菌期。發(fā)菌期間，每3~5天噴灑百病去無蹤等藥物1次預(yù)防雜菌污染。
嚴(yán)格控制，注意剔雜
發(fā)菌期間，嚴(yán)格進(jìn)行剔雜，一旦發(fā)生污染，立即將污染菌袋移到棚外，用藥處理，以防蔓延。
長(zhǎng)速較快，注意采早
秋季氣溫很適宜出菇，子實(shí)體生長(zhǎng)較快，每天都要補(bǔ)充肥水，促使菌蓋加厚，提高商品價(jià)值。由于子實(shí)體長(zhǎng)速較快，因此應(yīng)及時(shí)采收，原則是采早不采晚，寧可因采早而降低產(chǎn)量，也不能因采晚而使之老化。老化菇不但食用口感差，而且浪費(fèi)大量基料營(yíng)養(yǎng)，并且雞腿菇等品種，一旦采晚，便會(huì)開傘自溶，喪失商品價(jià)值。（曹德賓）
