轉(zhuǎn)基因育種技術(shù)與傳統(tǒng)育種技術(shù)在本質(zhì)上一脈相承，兩者的本質(zhì)都是通過(guò)改變基因及其組成獲得優(yōu)良性狀。
轉(zhuǎn)基因育種技術(shù)與傳統(tǒng)育種技術(shù)也有區(qū)別，傳統(tǒng)育種一般只能在生物物種內(nèi)個(gè)體上實(shí)現(xiàn)基因轉(zhuǎn)移，操作對(duì)象是整個(gè)基因組，不能準(zhǔn)確地對(duì)某個(gè)基因進(jìn)行選擇，選育周期長(zhǎng)，工作量大，雜交后代的表型不可預(yù)測(cè)。轉(zhuǎn)基因育種的優(yōu)勢(shì)在于可以打破物種界限，拓寬了遺傳資源的利用范圍，實(shí)現(xiàn)已知功能基因的定向高效轉(zhuǎn)移，使生物獲得人類需要的特定性狀，為高產(chǎn)、優(yōu)質(zhì)、抗逆農(nóng)業(yè)生物新品種培育提供了新的技術(shù)途徑。
這種基于對(duì)基因進(jìn)行精確定向操作的育種方法，效率更高，針對(duì)性更強(qiáng)。例如，轉(zhuǎn)基因抗蟲(chóng)棉就是將蘇云金芽孢桿菌中的殺蟲(chóng)蛋白基因轉(zhuǎn)移到棉花中，使棉花獲得抗棉鈴蟲(chóng)特性，減少農(nóng)藥使用，實(shí)現(xiàn)穩(wěn)產(chǎn)增產(chǎn)、提質(zhì)增效；耐草甘膦大豆就是將自然界中分離的耐草甘膦基因轉(zhuǎn)入大豆，從而在使用滅生性除草劑草甘膦除草時(shí)就能夠做到只除草而不危及大豆，既增加了種植密度，有效去除雜草，又能降低勞動(dòng)強(qiáng)度和除草成本，從而能夠提高大豆種植效益。
