近日,中國農(nóng)業(yè)科學院作物科學研究所玉米分子育種技術(shù)和應用創(chuàng)新團隊鄒棖、王平喜、徐云碧將DNA混池分析方法擴展為具有普遍適用性的混合樣品分析(bulked sample analysis),系統(tǒng)地闡述了適用于混合樣品分析的群體、抽樣和混合策略、標記類型和鑒定平臺、實驗設計原則及分析流程。相關(guān)評論和觀點文章《混合樣品分析在遺傳學、基因組學和作物改良中的應用》發(fā)表在最新一期的《植物生物技術(shù)雜志》(Plant Biotechnology Journal)上。
據(jù)介紹,上世紀90年代提出的混合分離體分析(bulked segregant analysis)或DNA混池分析(pooled DNA analysis)在遺傳學研究上得到廣泛應用。隨著高通量測序和分析技術(shù)的發(fā)展,DNA混池分析大大降低了分析成本,因而得到更為廣泛的應用。玉米分子育種創(chuàng)新團隊拓展的混合樣品分析方法可用于基因定位、 挖掘和克隆。它不受物種、群體或基因型分析平臺的限制,與物種是否具有參考基因組的無關(guān);既可以應于自然群體中,也可以應用于雙親分離群體;混合樣品分析適合于不同的基因型鑒定平臺,包括單個的分子標記、高密度標記芯片和基于測序的分子標記系統(tǒng)等?;旌蠘悠贩治隹稍诓煌姆肿铀缴线M行,包括 DNA、RNA和蛋白質(zhì)。研究人員可以從任何遺傳或育種群體中采集極端個體,分類后進行混合樣品的對比分析,也可以針對僅存的某種極端類型進行混合樣品分析。高通量的基因型鑒定技術(shù)與混合樣品分析相結(jié)合已經(jīng)成為快速挖掘優(yōu)良等位基因及變異、開發(fā)重要農(nóng)藝性狀分子標記的強大工具?;旌蠘悠贩治鰹槔没蚪M學技術(shù)和優(yōu)異種質(zhì)資源,挖掘重要農(nóng)藝性狀基因并應用于作物改良提供了捷徑。
玉米分子育種創(chuàng)新團隊近年來多次在國內(nèi)外重要學術(shù)會議上介紹混合樣品分析新策略。2016年5月17 -21日在“中德植物育種方法創(chuàng)新研討會”上,鄒棖博士系統(tǒng)介紹了混合樣品分析方法及其在遺傳學、基因組學和作物改良中的應用。2016年8月16日在第七屆國際作物科學大會上,創(chuàng)新團隊首席科學家徐云碧博士作了題為“利用混合樣本分析挖掘生物和非生物脅迫遺傳因子”的報告。與此同時,該創(chuàng)新團隊與國內(nèi)外同行合作,已將混合樣品分析策略應用于玉米大斑病和灰斑病抗性、低磷和漬害耐性等多個農(nóng)藝性狀的基因挖掘,并取得了預期的效果。
該論文自從今年3月正式接受并上線以來已引起國內(nèi)外同行的廣泛關(guān)注,短期內(nèi)被大量下載并引用。
相關(guān)論文見以下連接: http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/pbi.12559/full












