近日，中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院棉花研究所棉花功能基因組創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)以棉花品種“中棉所12”及其系譜為研究對(duì)象，鑒定到“中棉所12”豐產(chǎn)抗病相關(guān)的功能性片段，揭示了“中棉所12”豐產(chǎn)抗病的遺傳基礎(chǔ)。相關(guān)研究成果發(fā)表在《基因組生物學(xué)（Genome Biology）》上。
該研究組裝了“中棉所12”的高質(zhì)量參考基因組并對(duì)其20個(gè)系譜品種進(jìn)行了重測(cè)序，構(gòu)建了圖形化的系譜基因組，鑒定到623個(gè)與豐產(chǎn)抗病相關(guān)的功能性片段。遺傳模式分析發(fā)現(xiàn)，來(lái)源于“中棉所12”的優(yōu)異片段具有較低的遺傳穩(wěn)定性，較難遺傳給子代品種。進(jìn)一步研究表明，在品種驅(qū)動(dòng)型育種策略下，優(yōu)異片段的低遺傳穩(wěn)定性、功能片段的地理不均衡分布、系譜中指紋片段的存在是制約骨干親本育種潛力的遺傳基礎(chǔ)。研究結(jié)果為棉花育種工作從品種驅(qū)動(dòng)型向基因驅(qū)動(dòng)型轉(zhuǎn)變提供了理論依據(jù)，對(duì)加快優(yōu)異棉花骨干親本的育種應(yīng)用具有指導(dǎo)意義。
該研究得到國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃、三亞崖州灣科技城項(xiàng)目、國(guó)家自然科學(xué)基金等項(xiàng)目的資助。（通訊員 梁冰）
原文鏈接：https://doi.org/10.1186/s13059-023-03124-3
中棉所12系譜研究策略及功能基因挖掘
