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      轉(zhuǎn)基因性狀轉(zhuǎn)育過程中需要關(guān)注的風險

      放大字體  縮小字體 發(fā)布日期:2023-09-20  來源:南北學苑  作者:鐘舒陽  瀏覽次數(shù):1117
       

            以下文章來源于南北學苑 ,作者鐘舒陽

            性狀整合(Trait Integration)通俗的說法就是性狀回交轉(zhuǎn)育,即使用待整合的常規(guī)自交系(做母本)與攜帶轉(zhuǎn)基因性狀的自交系(做父本)進行一次雜交;再使用常規(guī)自交系作為輪回親本(受體),進行多次回交,從中篩選出既攜帶轉(zhuǎn)基因性狀,且DNA指紋和DUS表型與原常規(guī)自交系相同的家系;最后通過自交獲得轉(zhuǎn)基因性狀純合的自交系,用于下一步擴繁和制種。

            一、DBNBC的性狀整合

            1.1 性狀整合的注意事項

            DBNBC目前擁有三款轉(zhuǎn)基因性狀產(chǎn)品,分別是保抗®(DBN9936)、倍抗®(DBN 3601T)和庇護所(DBN9958),其中???reg;和倍抗®同時具有各自的靶標害蟲抗性和除草劑耐受性,庇護所具有草甘膦和草銨膦的除草劑耐受性。

            目前,DBNBC既提供回交轉(zhuǎn)育服務,也鼓勵育種單位自行回交轉(zhuǎn)育。下面就回交轉(zhuǎn)育過程和完成后的注意事項,列出6點:

            確保受體自交系的質(zhì)量。根據(jù)《國家級轉(zhuǎn)基因玉米品種審定標準(試行)》的要求,轉(zhuǎn)基因品種的受體品種已通過審定,除轉(zhuǎn)化體導入所致位點差異外,轉(zhuǎn)基因品種與受體品種的DNA指紋檢測差異位點數(shù)< 2個。因此,DBNBC會請第三方權(quán)威機構(gòu)對計劃回交轉(zhuǎn)育的自交系進行DNA指紋檢測,如果新自交系存在2個及以上的SSR雜合位點,會使用一套種子替換流程,在回交轉(zhuǎn)育進度和交付材料的DNA指紋達標之間尋找平衡。在此,也提醒各合作單位,盡量在完成自交系的純化后再提交種子,并且避免使用與非轉(zhuǎn)基因品種的制種親本來源不同的穗行。

            將抗蟲和耐除草劑性狀盡可能整合到母本中。一方面,???reg;和倍抗®具有抗蟲的轉(zhuǎn)基因性狀,所以DBNBC建議將轉(zhuǎn)基因性狀整合到育種單位的母本自交系中,降低制種成本,減少制種時的產(chǎn)量損失。另一方面,母本具有除草劑耐受性,在制雜交種的過程中,一旦出現(xiàn)母本去雄不徹底而自交的情況,也能保證混在雜交種中的自交種子攜帶轉(zhuǎn)基因性狀,避免在播種并噴施靶標除草劑后,出現(xiàn)死苗。

            轉(zhuǎn)育過程中,加強質(zhì)量管理。在每一世代,DBNBC都采取靶標除草劑噴施和分子檢測(目標轉(zhuǎn)化體基因型和非目標轉(zhuǎn)基因污染)相結(jié)合的質(zhì)控措施,并嚴格遵守一套授粉原則。育種單位自行回交時,如無分子檢測條件,一定要規(guī)范靶標除草劑的使用,保證剔除全部陰性苗。

            轉(zhuǎn)育過程中,充分運用分子篩選和表型鑒定,確保轉(zhuǎn)育質(zhì)量和效率。DBNBC采取分子篩選和DUS表型篩選相結(jié)合的策略,加快材料交付。分子篩選包括使用SNP進行背景選擇,使用SSR指紋(《GB/T 39914—2021 主要農(nóng)作物品種真實性和純度SSR 分子 標記檢測 玉米》)進行篩選。DUS表型篩選覆蓋39個玉米基本性狀(《GB/T 19557.24-2018 植物新品種特異性、一致性和穩(wěn)定性測試指南 玉米》),測試方法與指南保持一致。育種單位自行回交時,可以根據(jù)自己的需求,靈活調(diào)整篩選策略和群體量。

            轉(zhuǎn)育完成后,注重版本選擇。目前,DBNBC交付多個不同穗行來源的果穗,建議合作單位在完成配合力測試和抗性鑒定后,篩選出最優(yōu)穗行,再以該穗行進行大規(guī)模擴繁和制種,并且在擴繁過程中,遵循原種使用規(guī)則,避免自交衰退。

            根據(jù)轉(zhuǎn)基因產(chǎn)業(yè)化的進展,建議大家在選育出新自交系,并且純化穩(wěn)定后,及時開展轉(zhuǎn)基因性狀的回交轉(zhuǎn)育,并用完成轉(zhuǎn)基因回交轉(zhuǎn)育的材料組配新組合參試。

            1.2 性狀整合的2個風險點

            目前,DBNBC的性狀整合策略已經(jīng)基本成熟,但是在試驗過程中時常遇到兩點風險。第1個風險點是SNP結(jié)果與SSR指紋不能完全對應,其中又細分成兩種情況,一是當材料回交完成時,根據(jù)SNP數(shù)據(jù)計算的背景回復率已經(jīng)超過97%,甚至達到99%,但是SSR指紋與原始常規(guī)自交系仍然具有2~4個的差異位點;二是SSR指紋中的缺失值測定并不穩(wěn)定,導致無法準確判斷供體和受體之間的初始SSR差異位點數(shù),以及完成性狀整合的轉(zhuǎn)基因材料是否達標(差異位點數(shù)< 2個)。針對這一風險點,DBNBC目前采用SNP和SSR指紋檢測并行,并重復驗證的篩選策略,保證不影響性狀整合的進程和育種單位的品種審定。

            但是,從生物學意義上討論,SSR指紋相對SNP具有更豐富的多態(tài)性,而DBNBC用于篩選的SNP數(shù)量超過SSR指紋的2個數(shù)量級,對于SNP背景回復率已經(jīng)超過97%的轉(zhuǎn)基因材料,如果存在2個SSR差異位點,轉(zhuǎn)基因材料和常規(guī)受體材料是否是同一份材料?進一步,如果轉(zhuǎn)基因材料和常規(guī)受體材料同時在39個DUS表型上沒有明顯差異,是否能算做同一份材料?

            第2個風險點是熱源血緣材料在高緯度地區(qū)(長日照條件)的花期不遇,授粉困難。由于熱源材料在抗性等表型上具有優(yōu)勢,育種家目前已經(jīng)選育出很多攜帶熱源血緣的優(yōu)良自交系,但是,伴隨連鎖累贅等因素,部分熱源血緣材料在高緯度地區(qū)花期延長,ASI過大,導致花期不遇,授粉困難。目前,DBNBC通過提前與合作單位溝通,獲得材料花期/生育期信息,對熱源血緣材料增加錯期,調(diào)節(jié)光周期等手段,可以適當規(guī)避風險,保持性狀整合的試驗進程連續(xù)進行。在此,向各位老師請教,是否有簡單便捷的操作,可以實現(xiàn)熱源血緣材料在高緯度地區(qū)的正常生長?

            1.3 性狀整合的1種可能性

            當前,轉(zhuǎn)基因性狀整合手段以回交、前景(轉(zhuǎn)基因性狀)篩選和背景篩選為核心,整體周期偏長,并且針對轉(zhuǎn)基因插入位點附近的連鎖累贅篩選(LDS)投入較高。隨著基因編輯技術(shù)的日新月異,特別是大片段定向插入技術(shù)的發(fā)展,有可能完全顛覆現(xiàn)有的性狀整合手段——將獲得安全證書的轉(zhuǎn)化體片段定向插入常規(guī)自交系的指定位置,快速完成性狀整合,并完全規(guī)避連鎖累贅的風險。

            二、轉(zhuǎn)基因材料大規(guī)模繁制種時的目標轉(zhuǎn)化事件純度和非目標轉(zhuǎn)基因成分污染檢測的討論

            目前,無論是自交系還是雜交種,轉(zhuǎn)基因玉米材料純度的國家標準尚未確定。常規(guī)玉米材料對自交系的純度要求是原種99.9%,大田用種99%,對單交種的純度要求是大田用種96%(《GB 4404.1-2008 糧食作物種子 第1部分 禾谷類》)。如果轉(zhuǎn)基因玉米市場開放,無論常規(guī)或轉(zhuǎn)基因玉米材料,非目標轉(zhuǎn)基因成分污染肯定會納入監(jiān)管,需要檢測的轉(zhuǎn)化體數(shù)量也會超過現(xiàn)行的國家標準(《GB/T 19495.4-2018 轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品檢測 實時熒光定性聚合酶鏈式反應(PCR)檢測方法》,《GB/T 38505-2020轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品通用檢測方法》)。相對于常規(guī)材料,轉(zhuǎn)基因材料增加了目標轉(zhuǎn)化事件的純度檢測一項。目前,DBNBC采納國際種子檢驗協(xié)會(ISTA)的多篇文獻,對目標轉(zhuǎn)化事件的純度和非目標轉(zhuǎn)基因污染的檢測設置了超過常規(guī)材料國家標準的高閾值,對使用DBNBC轉(zhuǎn)基因性狀的玉米品種進行嚴格把關(guān)。

            在轉(zhuǎn)基因玉米材料純度的國家標準頒布之前,對合作單位有2點建議,一是在缺少分子檢測輔助的情況下,規(guī)范除草劑的使用,加強對目標轉(zhuǎn)化事件陰性苗的剔除,二是加強繁制種基地的隔離,最大程度避免非目標轉(zhuǎn)基因成分污染。無論是陰性苗還是非目標轉(zhuǎn)基因污染,一旦收獲并混合使用在同一批次的轉(zhuǎn)基因種子中,種植之后再檢測、剔苗等的成本是巨大的。

            三、入職體會

            入職DBNBC以來,逐漸深刻意識到轉(zhuǎn)基因玉米產(chǎn)業(yè)化是一個系統(tǒng)工程。在公司內(nèi)部,轉(zhuǎn)基因性狀整合只是整個環(huán)節(jié)的最后一步,現(xiàn)在可供育種單位進行性狀整合的三款轉(zhuǎn)基因性狀產(chǎn)品的前期研發(fā)和評估道路是艱辛和曲折的,十年磨一劍,這三款產(chǎn)品的抗性水平是扎實且穩(wěn)定的。

            另外和博士期間的基礎(chǔ)研究不同,在學校,個人完全掌握課題進度,需要對接的人比較少,通常是導師和幾位同課題的同學,有更高的容錯率,允許經(jīng)常性的臨時調(diào)整,但是在公司,一是以目標為導向,盡量減少摸索性質(zhì)的工作,充分討論試驗方案的可行性,充分考慮資源花費;二是涉及多個平臺間的合作,試驗計劃要提前完成并做好溝通,每一代的試驗進度要跟緊。

            以上,簡要介紹了DBNBC的轉(zhuǎn)基因性狀整合工作和幾點思考體會,前面還有很多東西要學,有很多路要走,歡迎各位老師對文中內(nèi)容進行指導和建議。

       
       
       
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