苦蕎富含黃酮類化合物，營養(yǎng)價值豐富，抗逆性和適應性極強，能夠生長在高寒、高海拔、低溫、低肥地區(qū)，在云南、貴州、四川等地均有大面積種植，是我國高寒山區(qū)重要的經(jīng)濟作物和糧食作物。我國的苦蕎種質(zhì)資源十分豐富，為了深入挖掘苦蕎種質(zhì)資源，我站和西南大學合作開展了苦蕎品種基因指紋圖譜構建項目。
研究團隊收集了318份苦蕎種質(zhì)資源（其中包含2份外國種質(zhì)資源），對它們的株高、主莖分枝數(shù)、主莖節(jié)數(shù)、籽粒長等11個主要農(nóng)藝性狀進行了分析，結果表明這些農(nóng)藝性狀均具有較廣的變異范圍，千粒重、籽粒面積、籽粒圓度、植株主莖分枝數(shù)變異系數(shù)較大，籽粒直徑變異系數(shù)較小。
用于分析苦蕎種質(zhì)資源的499對SSR引物中，有440對來源于西南大學方小梅老師根據(jù)苦蕎全基因組序列所開發(fā)，并以間隔1Mb距離隨機合成。通過篩選，研究團隊共獲得77對具有多態(tài)性且能穩(wěn)定擴增出條帶的SSR引物。利用這些引物對苦蕎種質(zhì)資源進行遺傳多樣性分析和聚類分析，318份苦蕎種質(zhì)資源被分為4個類群(Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ)，同一類群里的苦蕎種質(zhì)資源親緣關系較近。
根據(jù)遺傳多樣性分析結果，研究團隊進一步從77對引物中篩選出26對可以完全區(qū)分318份苦蕎種質(zhì)資源的核心引物，將它們的電泳分析結果進行數(shù)字轉(zhuǎn)化，有帶的記為“1”，無帶的記為“0”，構建了318個苦蕎種質(zhì)資源的指紋圖譜，并利用工具轉(zhuǎn)化為二維碼形式。
“酉蕎5號”的指紋圖譜
“酉蕎5號”的二維碼身份證
苦蕎種質(zhì)資源指紋圖譜庫建成后，可以對未來即將認定或引進的苦蕎資源進行26對SSR引物的鑒定，將其與該圖譜庫進行比對，從而鑒定其是否為新品種或新資源，對未來苦蕎新品種認定具有重要的參考價值。此外，利用該圖譜可挖掘出318份苦蕎資源中親緣關系較遠的種質(zhì)資源進行雜交育種，提高雜種優(yōu)勢。
研究團隊匯總了26對苦蕎核心引物的信息分析結果，形成了《苦蕎純度及真實性鑒定技術規(guī)程SSR標記法》申報書，計劃申請重慶市地方標準。
在結題驗收會上，由中國農(nóng)科院作物所、重慶市農(nóng)業(yè)廣播電視學校、重慶市科技局、重慶市農(nóng)科院專家組成的驗收小組對該項目給予了高度評價。專家組建議研究團隊將苦蕎品種純度及真實性SSR分子標記成果申報全國行業(yè)標準，并申請新項目對苦蕎種質(zhì)資源的SSR分子標記方法進行深入研究，以更好地保護和挖掘種質(zhì)資源。
苦蕎種質(zhì)資源基因指紋圖譜構建工作的完成，對于苦蕎種質(zhì)資源的評價、品種的鑒定、分子輔助育種、優(yōu)良基因的定位及克隆具有重要的意義。
