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        白菜和甘藍(lán)類蔬菜葉球形成和根膨大相關(guān)基因確定

        放大字體  縮小字體 發(fā)布日期:2016-08-17  來源:中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜花卉研究所  作者:王曉武  瀏覽次數(shù):160
         
         
            近日,從中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜花卉研究所了解到,蔬菜所王曉武研究員領(lǐng)銜的科研團(tuán)隊(duì)通過深入研究白菜和甘藍(lán)兩類蕓薹屬作物,獲得了白菜和甘藍(lán)類蔬菜作物全基因組的大量變異,確定了一批與白菜類和甘藍(lán)類蔬菜葉球形成和根(莖)膨大有關(guān)的重要基因,為加快白菜類與甘藍(lán)類蔬菜分子育種奠定了重要基礎(chǔ)。相關(guān)研究結(jié)果于8月15日在線發(fā)表于《自然•遺傳(Nature Genetics)》上。 
         
         
            白菜和甘藍(lán)類蔬菜是我國人民餐桌上最常見的蔬菜。這兩類蔬菜最大的特點(diǎn)就是類型極其豐富多樣。白菜類常見的有大白菜、小白菜、蕪菁、菜心、紫菜薹、烏菜、烏塌菜和薹菜,此外還有日本的水菜、小菘菜,歐洲的意大利菜心等。而甘藍(lán)類常見的蔬菜則包括結(jié)球甘藍(lán)、苤藍(lán)、羽衣甘藍(lán)、芥蘭、花椰菜、青花菜、孢子甘藍(lán)等等。此外,在500年前中國人將白菜馴化出結(jié)球大白菜,歐洲人將甘藍(lán)馴化出結(jié)球甘藍(lán);2000年前歐洲人將白菜馴化出根膨大的蕪菁,同時(shí)500年前又將甘藍(lán)馴化出莖膨大的苤藍(lán)。這兩個(gè)物種為什么能被馴化出如此多樣的類型。為什么經(jīng)過我們祖先獨(dú)立的馴化,都能形成葉球或者膨大根(莖)這樣非常相似的性狀?這一直是一個(gè)待解的難題。
         
         
            為了解開上述謎題, 王曉武帶領(lǐng)團(tuán)隊(duì)完成了白菜和甘藍(lán)類蔬菜作物代表材料的基因組重測序,構(gòu)建了白菜和甘藍(lán)類蔬菜的群體基因組變異圖譜。在充分利用模式物種擬南芥基因組豐富的基因信息基礎(chǔ)上,分別確定了一大批白菜和甘藍(lán)葉球形成與膨大根(莖)馴化選擇的基因組信號與相關(guān)的基因。發(fā)現(xiàn)葉球的形成與多種植物激素信號傳導(dǎo)相關(guān)基因以及葉片背性和腹性兩類不同極性形成的基因受高度選擇相關(guān)。膨大根(莖)的形成除與生長素相關(guān)基因受選擇有關(guān)外,還與細(xì)胞快速膨大和糖轉(zhuǎn)運(yùn)相關(guān)基因的選擇有關(guān)。
         
            研究發(fā)現(xiàn),白菜和甘藍(lán)這兩個(gè)物種分別產(chǎn)生結(jié)球白菜和結(jié)球甘藍(lán),蕪菁和苤藍(lán)這樣具有相似的產(chǎn)品器官的現(xiàn)象與其共同祖先的一次全基因組三倍化事件有關(guān)。在距今約1100萬年前,蕓薹屬的祖先發(fā)生了一次基因組三倍化復(fù)制事件,這次事件形成了蕓薹屬基因組的三套亞基因組。這一特殊的進(jìn)化事件對于蕓薹屬物種的演化和該屬作物的形成具有深遠(yuǎn)的影響。通過分析選擇信號與亞基因組的關(guān)系,獲得兩個(gè)重要發(fā)現(xiàn)。第一,亞基因組的存在促進(jìn)了結(jié)球性狀、根(莖)膨大等性狀的馴化,進(jìn)而形成器官形態(tài)的多樣性。第二,同源基因的平行選擇是導(dǎo)致不同物種馴化形成類似產(chǎn)品器官的重要原因。 


         
            據(jù)了解,該科研團(tuán)隊(duì)多年從事蕓薹屬物種的研究,主導(dǎo)完成了白菜基因組測序工作,該研究是前期工作的深入,受到了科技部和國家自然基金的項(xiàng)目資助。程鋒是論文的第一作者,合作單位包括荷蘭瓦赫寧根大學(xué)、南京農(nóng)大和北京市農(nóng)科院蔬菜中心。(通訊員 李海芬)
         
            文章鏈接:http://www.nature.com/ng/journal/vaop/ncurrent/full/ng.3634.html
         
         
         
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