日前，深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所（以下簡稱“基因所”）的最新研究成果，在線發(fā)表于權(quán)威學(xué)術(shù)期刊《NatureGenetics（自然·遺傳學(xué)）》雜志上?；蛩ㄟ^對360份番茄種質(zhì)全基因組的分析，闡明了番茄馴化和育種的基因組學(xué)歷史，為番茄生物學(xué)研究提供了新的工具，奠定了番茄全基因組設(shè)計育種的基礎(chǔ)。這項研究是我國在番茄研究方面繼2012年完成番茄全基因組序列圖的繪制后另一重要成果，極大推進(jìn)了番茄基因組研究的進(jìn)程。
據(jù)該研究團隊主要負(fù)責(zé)人黃三文研究員介紹，番茄起源于南美洲的印地斯山脈，隨著人類遷移經(jīng)由北美洲傳到歐洲，逐漸擴散到世界各地。如今番茄的品種多樣，是世界范圍內(nèi)普遍種植的第一大蔬菜作物，每年全球市場總價值達(dá)550億美元。同時，番茄也是植物遺傳、發(fā)育和生理研究的重要模式系統(tǒng)。我們?nèi)粘Ｊ秤玫拇蠊耘喾咽怯梢吧疡Z化而來的，野生番茄果實非常小，只有1克~2克重，經(jīng)過長期的人工馴化，現(xiàn)代栽培番茄的果重是其祖先的100多倍。然而，番茄果實變大的人工馴化過程一直缺乏全面研究。
因此，基因所借助最新配置的超算平臺進(jìn)行基因組大數(shù)據(jù)分析，發(fā)現(xiàn)番茄果實變大經(jīng)歷了從野生醋栗番茄形成櫻桃番茄，最終成為大果栽培番茄的兩步馴化過程，分別有5個和13個基因受到了人工定向選擇。同時，發(fā)現(xiàn)了加工番茄（主要用于番茄醬加工）的主要基因組特征，闡明了粉果番茄形成的原因。這些研究成果為番茄育種提供了有效的分子工具。
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