二倍體棉花—雷蒙德氏棉全基因組圖繪制完成
本報安陽9月7日訊（記者黃明明）記者今天從河南省安陽市召開的“二倍體棉花—雷蒙德氏棉全基因組圖繪制完成”新聞發(fā)布會上獲悉，在中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院棉花研究所的主持下，深圳華大基因研究院、北京大學(xué)、美國農(nóng)業(yè)部南方平原研究中心、哥本哈根大學(xué)、荷蘭瓦赫寧根大學(xué)等單位共同合作完成了二倍體棉花—雷蒙德氏棉的全基因組草圖。日前，研究成果以《二倍體棉花—雷蒙德氏棉的基因組草圖》為題在線發(fā)表于國際學(xué)術(shù)期刊《自然—遺傳學(xué)》。
業(yè)內(nèi)專家表示，該成果將對棉花基礎(chǔ)研究和應(yīng)用研究發(fā)揮巨大的推動作用，為我國棉花重要功能基因挖掘與利用、分子育種，乃至全基因組設(shè)計育種提供前所未有的機遇。
據(jù)了解，棉花除作為全球重要的經(jīng)濟作物之外，還是一種研究多倍體化、細胞伸長和細胞壁生物合成極好的模式系統(tǒng)。雷蒙德氏棉是現(xiàn)在陸地棉祖先的兩個供體種之一，該棉花基因草圖的完成，為進一步解析陸地棉全基因組序列奠定了堅實的基礎(chǔ)。
研究團隊采用全基因組鳥槍法結(jié)合新一代的高通量DNA測序技術(shù)，對雷蒙德氏棉進行了全基因組測序，獲得了其87.7%的全基因組序列。研究結(jié)果證明，棉花基因組經(jīng)歷了真雙子葉植物共同經(jīng)歷的一次古六倍化事件和一次棉屬特異的全基因組復(fù)制事件，表明了其古多倍體起源。
此外，研究人員推測雷蒙德氏棉基因組約包含40976個蛋白質(zhì)編碼基因，并從基因組注釋結(jié)果中發(fā)現(xiàn)了2706個轉(zhuǎn)錄因子，其中大量的MYB和bHLH基因在花后0天和3天的胚珠中表達。該結(jié)果暗示這些基因可能為早期纖維發(fā)育所必需。
